Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK4Q16099 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms