Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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