Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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