Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
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