Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF4Q15306 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms