Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
GAPVD1Q14C86 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
GAPVD1Q14C86 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
GAPVD1Q14C86 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.7
GAPVD1Q14C86 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.7
GAPVD1Q14C86 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
GAPVD1Q14C86 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC31.95■■■□□ 2.7
GAPVD1Q14C86 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
GAPVD1Q14C86 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
GAPVD1Q14C86 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
GAPVD1Q14C86 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
GAPVD1Q14C86 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
GAPVD1Q14C86 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
GAPVD1Q14C86 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
GAPVD1Q14C86 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
GAPVD1Q14C86 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
GAPVD1Q14C86 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
GAPVD1Q14C86 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
GAPVD1Q14C86 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
GAPVD1Q14C86 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
GAPVD1Q14C86 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
GAPVD1Q14C86 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
GAPVD1Q14C86 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
GAPVD1Q14C86 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
GAPVD1Q14C86 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
GAPVD1Q14C86 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
GAPVD1Q14C86 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
GAPVD1Q14C86 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
GAPVD1Q14C86 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
GAPVD1Q14C86 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
GAPVD1Q14C86 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
GAPVD1Q14C86 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
GAPVD1Q14C86 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
GAPVD1Q14C86 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
GAPVD1Q14C86 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
GAPVD1Q14C86 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
GAPVD1Q14C86 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
GAPVD1Q14C86 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
GAPVD1Q14C86 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
GAPVD1Q14C86 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
GAPVD1Q14C86 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
GAPVD1Q14C86 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
GAPVD1Q14C86 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
GAPVD1Q14C86 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
GAPVD1Q14C86 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
GAPVD1Q14C86 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
GAPVD1Q14C86 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
GAPVD1Q14C86 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
GAPVD1Q14C86 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
GAPVD1Q14C86 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
GAPVD1Q14C86 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
GAPVD1Q14C86 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
GAPVD1Q14C86 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
GAPVD1Q14C86 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
GAPVD1Q14C86 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
GAPVD1Q14C86 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
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