Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
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