Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms