Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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COL9A2Q14055 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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COL9A2Q14055 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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COL9A2Q14055 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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COL9A2Q14055 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
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COL9A2Q14055 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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