Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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