Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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