Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LAMB3Q13751 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms