Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
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