Protein–RNA interactions for Protein: Q13636

RAB31, Ras-related protein Rab-31, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB31Q13636 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB31Q13636 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms