Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTCH1Q13635 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTCH1Q13635 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
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