Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
GRIN2BQ13224 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
GRIN2BQ13224 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
GRIN2BQ13224 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
GRIN2BQ13224 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
GRIN2BQ13224 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
GRIN2BQ13224 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
GRIN2BQ13224 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
GRIN2BQ13224 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
GRIN2BQ13224 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
GRIN2BQ13224 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
GRIN2BQ13224 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
GRIN2BQ13224 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
GRIN2BQ13224 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
GRIN2BQ13224 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
GRIN2BQ13224 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
GRIN2BQ13224 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
GRIN2BQ13224 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC31.86■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC31.83■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC31.83■■■□□ 2.69
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