Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PRDM2Q13029 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
PRDM2Q13029 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
PRDM2Q13029 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PRDM2Q13029 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PRDM2Q13029 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PRDM2Q13029 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PRDM2Q13029 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PRDM2Q13029 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PRDM2Q13029 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PRDM2Q13029 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PRDM2Q13029 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PRDM2Q13029 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PRDM2Q13029 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PRDM2Q13029 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PRDM2Q13029 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PRDM2Q13029 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PRDM2Q13029 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PRDM2Q13029 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PRDM2Q13029 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PRDM2Q13029 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PRDM2Q13029 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PRDM2Q13029 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
PRDM2Q13029 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PRDM2Q13029 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PRDM2Q13029 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PRDM2Q13029 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PRDM2Q13029 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PRDM2Q13029 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
PRDM2Q13029 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
PRDM2Q13029 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PRDM2Q13029 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PRDM2Q13029 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
PRDM2Q13029 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PRDM2Q13029 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PRDM2Q13029 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PRDM2Q13029 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PRDM2Q13029 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PRDM2Q13029 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PRDM2Q13029 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PRDM2Q13029 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PRDM2Q13029 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PRDM2Q13029 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PRDM2Q13029 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PRDM2Q13029 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PRDM2Q13029 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PRDM2Q13029 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PRDM2Q13029 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PRDM2Q13029 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PRDM2Q13029 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PRDM2Q13029 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PRDM2Q13029 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
PRDM2Q13029 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PRDM2Q13029 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PRDM2Q13029 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PRDM2Q13029 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PRDM2Q13029 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PRDM2Q13029 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PRDM2Q13029 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PRDM2Q13029 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC33.14■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PRDM2Q13029 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
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