Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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PTPRJQ12913 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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PTPRJQ12913 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
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PTPRJQ12913 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
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PTPRJQ12913 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
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PTPRJQ12913 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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PTPRJQ12913 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
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PTPRJQ12913 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
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PTPRJQ12913 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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