Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC31.45■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.45■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms