Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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