Protein–RNA interactions for Protein: Q07889

SOS1, Son of sevenless homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOS1Q07889 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOS1Q07889 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOS1Q07889 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOS1Q07889 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOS1Q07889 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOS1Q07889 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOS1Q07889 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOS1Q07889 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOS1Q07889 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOS1Q07889 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOS1Q07889 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms