Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FMODQ06828 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FMODQ06828 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FMODQ06828 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FMODQ06828 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
FMODQ06828 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FMODQ06828 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FMODQ06828 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FMODQ06828 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FMODQ06828 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FMODQ06828 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FMODQ06828 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FMODQ06828 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FMODQ06828 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FMODQ06828 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FMODQ06828 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FMODQ06828 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FMODQ06828 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FMODQ06828 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FMODQ06828 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FMODQ06828 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
FMODQ06828 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FMODQ06828 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FMODQ06828 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FMODQ06828 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FMODQ06828 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FMODQ06828 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FMODQ06828 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FMODQ06828 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
FMODQ06828 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FMODQ06828 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FMODQ06828 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FMODQ06828 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FMODQ06828 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FMODQ06828 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FMODQ06828 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FMODQ06828 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FMODQ06828 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FMODQ06828 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FMODQ06828 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FMODQ06828 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FMODQ06828 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FMODQ06828 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FMODQ06828 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FMODQ06828 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FMODQ06828 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FMODQ06828 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FMODQ06828 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FMODQ06828 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FMODQ06828 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FMODQ06828 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FMODQ06828 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FMODQ06828 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FMODQ06828 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FMODQ06828 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FMODQ06828 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FMODQ06828 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FMODQ06828 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FMODQ06828 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FMODQ06828 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FMODQ06828 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FMODQ06828 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FMODQ06828 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FMODQ06828 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FMODQ06828 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FMODQ06828 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FMODQ06828 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FMODQ06828 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FMODQ06828 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FMODQ06828 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FMODQ06828 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FMODQ06828 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FMODQ06828 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FMODQ06828 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FMODQ06828 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FMODQ06828 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FMODQ06828 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FMODQ06828 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
FMODQ06828 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FMODQ06828 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FMODQ06828 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FMODQ06828 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FMODQ06828 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FMODQ06828 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FMODQ06828 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FMODQ06828 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FMODQ06828 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FMODQ06828 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FMODQ06828 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FMODQ06828 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FMODQ06828 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FMODQ06828 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FMODQ06828 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FMODQ06828 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FMODQ06828 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FMODQ06828 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FMODQ06828 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FMODQ06828 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FMODQ06828 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FMODQ06828 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms