Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABPAQ06546 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms