Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN11Q06124 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms