Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 SLC14A1-206ENST00000535474 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 AC090515.5-201ENST00000560378 526 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 AC012370.2-204ENST00000601940 1320 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 CCDC152-202ENST00000388827 1237 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 AC106795.5-201ENST00000623288 454 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 AC092723.2-201ENST00000624955 793 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 RIMKLB-213ENST00000619374 1519 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms