Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms