Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HSF1Q00613 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms