Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms