Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK5Q00535 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK5Q00535 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK5Q00535 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK5Q00535 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK5Q00535 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK5Q00535 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK5Q00535 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK5Q00535 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK5Q00535 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK5Q00535 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK5Q00535 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK5Q00535 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK5Q00535 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK5Q00535 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK5Q00535 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK5Q00535 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK5Q00535 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK5Q00535 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK5Q00535 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK5Q00535 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK5Q00535 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK5Q00535 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK5Q00535 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK5Q00535 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK5Q00535 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK5Q00535 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK5Q00535 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK5Q00535 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK5Q00535 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDK5Q00535 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDK5Q00535 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDK5Q00535 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5Q00535 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5Q00535 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5Q00535 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5Q00535 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5Q00535 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5Q00535 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5Q00535 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5Q00535 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5Q00535 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5Q00535 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5Q00535 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5Q00535 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5Q00535 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5Q00535 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5Q00535 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5Q00535 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5Q00535 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5Q00535 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5Q00535 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5Q00535 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5Q00535 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5Q00535 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5Q00535 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5Q00535 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5Q00535 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5Q00535 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5Q00535 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5Q00535 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5Q00535 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5Q00535 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5Q00535 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5Q00535 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5Q00535 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5Q00535 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5Q00535 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5Q00535 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5Q00535 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5Q00535 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK5Q00535 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK5Q00535 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK5Q00535 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK5Q00535 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK5Q00535 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK5Q00535 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK5Q00535 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK5Q00535 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK5Q00535 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK5Q00535 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK5Q00535 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK5Q00535 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK5Q00535 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK5Q00535 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK5Q00535 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK5Q00535 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK5Q00535 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK5Q00535 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK5Q00535 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK5Q00535 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK5Q00535 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK5Q00535 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK5Q00535 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK5Q00535 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK5Q00535 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK5Q00535 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK5Q00535 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK5Q00535 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK5Q00535 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms