Protein–RNA interactions for Protein: P78371

CCT2, T-complex protein 1 subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT2P78371 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT2P78371 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT2P78371 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT2P78371 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT2P78371 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT2P78371 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT2P78371 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT2P78371 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT2P78371 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT2P78371 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT2P78371 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT2P78371 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT2P78371 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT2P78371 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT2P78371 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT2P78371 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT2P78371 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT2P78371 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT2P78371 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT2P78371 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT2P78371 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT2P78371 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT2P78371 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT2P78371 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT2P78371 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT2P78371 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT2P78371 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT2P78371 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT2P78371 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT2P78371 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT2P78371 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT2P78371 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT2P78371 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT2P78371 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT2P78371 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT2P78371 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT2P78371 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT2P78371 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT2P78371 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT2P78371 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT2P78371 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT2P78371 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT2P78371 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT2P78371 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT2P78371 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT2P78371 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT2P78371 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT2P78371 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT2P78371 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT2P78371 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT2P78371 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT2P78371 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT2P78371 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT2P78371 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT2P78371 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT2P78371 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT2P78371 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT2P78371 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT2P78371 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT2P78371 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT2P78371 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT2P78371 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT2P78371 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT2P78371 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT2P78371 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT2P78371 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT2P78371 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT2P78371 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT2P78371 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT2P78371 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT2P78371 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT2P78371 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT2P78371 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT2P78371 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT2P78371 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT2P78371 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT2P78371 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT2P78371 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT2P78371 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT2P78371 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT2P78371 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT2P78371 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT2P78371 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT2P78371 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT2P78371 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT2P78371 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT2P78371 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT2P78371 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT2P78371 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT2P78371 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT2P78371 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT2P78371 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT2P78371 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT2P78371 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT2P78371 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT2P78371 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT2P78371 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT2P78371 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT2P78371 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT2P78371 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms