Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNB1P62873 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNB1P62873 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNB1P62873 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNB1P62873 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNB1P62873 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNB1P62873 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNB1P62873 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNB1P62873 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNB1P62873 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNB1P62873 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNB1P62873 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNB1P62873 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNB1P62873 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNB1P62873 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNB1P62873 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNB1P62873 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNB1P62873 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNB1P62873 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNB1P62873 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNB1P62873 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNB1P62873 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNB1P62873 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNB1P62873 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNB1P62873 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNB1P62873 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNB1P62873 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNB1P62873 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNB1P62873 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GNB1P62873 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNB1P62873 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNB1P62873 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNB1P62873 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNB1P62873 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNB1P62873 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNB1P62873 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNB1P62873 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNB1P62873 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNB1P62873 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNB1P62873 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNB1P62873 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNB1P62873 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNB1P62873 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNB1P62873 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNB1P62873 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNB1P62873 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNB1P62873 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNB1P62873 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNB1P62873 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNB1P62873 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNB1P62873 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNB1P62873 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNB1P62873 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNB1P62873 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNB1P62873 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNB1P62873 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNB1P62873 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNB1P62873 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNB1P62873 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNB1P62873 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNB1P62873 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNB1P62873 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNB1P62873 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNB1P62873 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNB1P62873 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNB1P62873 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNB1P62873 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GNB1P62873 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNB1P62873 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNB1P62873 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNB1P62873 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNB1P62873 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNB1P62873 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNB1P62873 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNB1P62873 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNB1P62873 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNB1P62873 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNB1P62873 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNB1P62873 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNB1P62873 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GNB1P62873 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GNB1P62873 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GNB1P62873 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
GNB1P62873 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GNB1P62873 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GNB1P62873 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GNB1P62873 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GNB1P62873 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GNB1P62873 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GNB1P62873 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GNB1P62873 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GNB1P62873 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GNB1P62873 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GNB1P62873 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GNB1P62873 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GNB1P62873 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GNB1P62873 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GNB1P62873 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GNB1P62873 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GNB1P62873 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms