Protein–RNA interactions for Protein: P60842

EIF4A1, Eukaryotic initiation factor 4A-I, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A1P60842 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EIF4A1P60842 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EIF4A1P60842 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EIF4A1P60842 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EIF4A1P60842 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EIF4A1P60842 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EIF4A1P60842 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EIF4A1P60842 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EIF4A1P60842 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EIF4A1P60842 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
EIF4A1P60842 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EIF4A1P60842 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms