Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRP1P56182 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRP1P56182 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRP1P56182 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRP1P56182 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRP1P56182 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRP1P56182 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRP1P56182 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRP1P56182 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRP1P56182 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRP1P56182 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRP1P56182 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRP1P56182 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RRP1P56182 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRP1P56182 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRP1P56182 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRP1P56182 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRP1P56182 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRP1P56182 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRP1P56182 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RRP1P56182 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRP1P56182 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRP1P56182 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRP1P56182 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRP1P56182 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRP1P56182 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRP1P56182 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRP1P56182 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRP1P56182 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRP1P56182 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRP1P56182 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RRP1P56182 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRP1P56182 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRP1P56182 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRP1P56182 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRP1P56182 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRP1P56182 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RRP1P56182 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRP1P56182 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRP1P56182 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRP1P56182 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRP1P56182 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRP1P56182 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRP1P56182 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRP1P56182 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRP1P56182 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRP1P56182 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRP1P56182 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRP1P56182 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRP1P56182 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRP1P56182 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRP1P56182 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRP1P56182 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRP1P56182 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRP1P56182 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRP1P56182 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRP1P56182 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RRP1P56182 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
RRP1P56182 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RRP1P56182 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RRP1P56182 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RRP1P56182 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RRP1P56182 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RRP1P56182 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RRP1P56182 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RRP1P56182 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RRP1P56182 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RRP1P56182 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RRP1P56182 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RRP1P56182 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RRP1P56182 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RRP1P56182 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RRP1P56182 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RRP1P56182 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RRP1P56182 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RRP1P56182 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRP1P56182 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRP1P56182 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRP1P56182 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRP1P56182 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRP1P56182 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRP1P56182 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRP1P56182 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRP1P56182 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRP1P56182 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RRP1P56182 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRP1P56182 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRP1P56182 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRP1P56182 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRP1P56182 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRP1P56182 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRP1P56182 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRP1P56182 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRP1P56182 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRP1P56182 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRP1P56182 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRP1P56182 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRP1P56182 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRP1P56182 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRP1P56182 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms