Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms