Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GPC3P51654 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GPC3P51654 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPC3P51654 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPC3P51654 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPC3P51654 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPC3P51654 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPC3P51654 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPC3P51654 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPC3P51654 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPC3P51654 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPC3P51654 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPC3P51654 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPC3P51654 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPC3P51654 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPC3P51654 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPC3P51654 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPC3P51654 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPC3P51654 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPC3P51654 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPC3P51654 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPC3P51654 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPC3P51654 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GPC3P51654 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPC3P51654 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPC3P51654 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPC3P51654 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPC3P51654 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GPC3P51654 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPC3P51654 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GPC3P51654 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPC3P51654 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPC3P51654 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPC3P51654 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPC3P51654 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPC3P51654 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPC3P51654 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPC3P51654 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPC3P51654 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPC3P51654 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPC3P51654 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPC3P51654 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPC3P51654 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPC3P51654 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPC3P51654 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPC3P51654 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPC3P51654 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPC3P51654 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPC3P51654 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPC3P51654 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPC3P51654 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPC3P51654 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPC3P51654 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPC3P51654 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPC3P51654 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPC3P51654 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPC3P51654 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPC3P51654 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPC3P51654 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPC3P51654 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPC3P51654 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
GPC3P51654 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
GPC3P51654 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPC3P51654 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPC3P51654 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPC3P51654 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPC3P51654 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GPC3P51654 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPC3P51654 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPC3P51654 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPC3P51654 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPC3P51654 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPC3P51654 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GPC3P51654 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPC3P51654 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPC3P51654 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GPC3P51654 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPC3P51654 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPC3P51654 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPC3P51654 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPC3P51654 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GPC3P51654 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPC3P51654 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPC3P51654 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPC3P51654 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPC3P51654 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPC3P51654 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPC3P51654 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPC3P51654 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GPC3P51654 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPC3P51654 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPC3P51654 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPC3P51654 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPC3P51654 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPC3P51654 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPC3P51654 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPC3P51654 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPC3P51654 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPC3P51654 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPC3P51654 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms