Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERFP50548 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERFP50548 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERFP50548 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERFP50548 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERFP50548 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERFP50548 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERFP50548 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERFP50548 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERFP50548 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERFP50548 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERFP50548 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERFP50548 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERFP50548 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERFP50548 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERFP50548 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERFP50548 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERFP50548 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERFP50548 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERFP50548 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERFP50548 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ERFP50548 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERFP50548 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERFP50548 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERFP50548 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERFP50548 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERFP50548 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ERFP50548 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERFP50548 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERFP50548 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERFP50548 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERFP50548 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERFP50548 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERFP50548 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERFP50548 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERFP50548 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERFP50548 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERFP50548 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERFP50548 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERFP50548 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ERFP50548 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERFP50548 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ERFP50548 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERFP50548 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERFP50548 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERFP50548 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERFP50548 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERFP50548 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERFP50548 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ERFP50548 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERFP50548 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERFP50548 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ERFP50548 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERFP50548 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERFP50548 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERFP50548 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERFP50548 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERFP50548 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERFP50548 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERFP50548 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERFP50548 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERFP50548 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERFP50548 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
ERFP50548 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERFP50548 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERFP50548 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERFP50548 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERFP50548 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERFP50548 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERFP50548 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERFP50548 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERFP50548 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERFP50548 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERFP50548 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERFP50548 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ERFP50548 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERFP50548 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ERFP50548 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERFP50548 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERFP50548 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERFP50548 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERFP50548 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERFP50548 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERFP50548 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERFP50548 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERFP50548 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERFP50548 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERFP50548 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERFP50548 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERFP50548 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERFP50548 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERFP50548 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERFP50548 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERFP50548 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERFP50548 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERFP50548 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERFP50548 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERFP50548 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERFP50548 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERFP50548 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms