Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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CENPFP49454 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPFP49454 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPFP49454 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPFP49454 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPFP49454 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPFP49454 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPFP49454 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPFP49454 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPFP49454 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPFP49454 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPFP49454 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPFP49454 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPFP49454 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPFP49454 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPFP49454 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPFP49454 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPFP49454 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPFP49454 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPFP49454 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPFP49454 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPFP49454 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPFP49454 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPFP49454 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPFP49454 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPFP49454 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPFP49454 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPFP49454 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPFP49454 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
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CENPFP49454 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPFP49454 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPFP49454 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPFP49454 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPFP49454 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPFP49454 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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CENPFP49454 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPFP49454 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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CENPFP49454 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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CENPFP49454 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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CENPFP49454 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPFP49454 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPFP49454 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPFP49454 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPFP49454 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPFP49454 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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