Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRA4P48169 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRA4P48169 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRA4P48169 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRA4P48169 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA4P48169 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms