Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
USP5P45974 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
USP5P45974 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP5P45974 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP5P45974 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP5P45974 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP5P45974 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP5P45974 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
USP5P45974 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP5P45974 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
USP5P45974 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP5P45974 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP5P45974 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP5P45974 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP5P45974 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP5P45974 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP5P45974 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP5P45974 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP5P45974 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP5P45974 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP5P45974 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP5P45974 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP5P45974 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP5P45974 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP5P45974 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP5P45974 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP5P45974 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP5P45974 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP5P45974 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP5P45974 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP5P45974 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP5P45974 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
USP5P45974 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP5P45974 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP5P45974 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP5P45974 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
USP5P45974 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
USP5P45974 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP5P45974 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP5P45974 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP5P45974 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP5P45974 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP5P45974 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP5P45974 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP5P45974 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP5P45974 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP5P45974 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP5P45974 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP5P45974 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP5P45974 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
USP5P45974 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP5P45974 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP5P45974 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP5P45974 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP5P45974 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP5P45974 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP5P45974 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP5P45974 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP5P45974 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP5P45974 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP5P45974 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP5P45974 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP5P45974 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP5P45974 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP5P45974 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP5P45974 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP5P45974 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP5P45974 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP5P45974 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP5P45974 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP5P45974 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP5P45974 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP5P45974 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
USP5P45974 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP5P45974 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP5P45974 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
USP5P45974 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP5P45974 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP5P45974 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP5P45974 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP5P45974 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP5P45974 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
USP5P45974 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP5P45974 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP5P45974 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP5P45974 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP5P45974 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP5P45974 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP5P45974 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP5P45974 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP5P45974 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP5P45974 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP5P45974 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP5P45974 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
USP5P45974 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP5P45974 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
USP5P45974 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP5P45974 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP5P45974 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP5P45974 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms