Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AFMP43652 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AFMP43652 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AFMP43652 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AFMP43652 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AFMP43652 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
AFMP43652 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
AFMP43652 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
AFMP43652 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AFMP43652 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AFMP43652 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AFMP43652 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AFMP43652 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AFMP43652 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AFMP43652 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AFMP43652 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AFMP43652 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AFMP43652 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AFMP43652 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AFMP43652 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AFMP43652 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AFMP43652 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AFMP43652 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
AFMP43652 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AFMP43652 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AFMP43652 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AFMP43652 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AFMP43652 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AFMP43652 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AFMP43652 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AFMP43652 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AFMP43652 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AFMP43652 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AFMP43652 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AFMP43652 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AFMP43652 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AFMP43652 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AFMP43652 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AFMP43652 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AFMP43652 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AFMP43652 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AFMP43652 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AFMP43652 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AFMP43652 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AFMP43652 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AFMP43652 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AFMP43652 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AFMP43652 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AFMP43652 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AFMP43652 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AFMP43652 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AFMP43652 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AFMP43652 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AFMP43652 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AFMP43652 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AFMP43652 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AFMP43652 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AFMP43652 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AFMP43652 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AFMP43652 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AFMP43652 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AFMP43652 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AFMP43652 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AFMP43652 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AFMP43652 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AFMP43652 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AFMP43652 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AFMP43652 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AFMP43652 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AFMP43652 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AFMP43652 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AFMP43652 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AFMP43652 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AFMP43652 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AFMP43652 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AFMP43652 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AFMP43652 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AFMP43652 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AFMP43652 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
AFMP43652 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AFMP43652 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AFMP43652 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AFMP43652 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AFMP43652 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AFMP43652 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AFMP43652 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AFMP43652 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AFMP43652 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AFMP43652 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AFMP43652 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AFMP43652 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AFMP43652 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AFMP43652 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AFMP43652 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AFMP43652 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AFMP43652 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AFMP43652 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AFMP43652 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AFMP43652 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AFMP43652 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms