Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LTBRP36941 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LTBRP36941 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LTBRP36941 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LTBRP36941 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LTBRP36941 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LTBRP36941 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LTBRP36941 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LTBRP36941 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LTBRP36941 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LTBRP36941 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LTBRP36941 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LTBRP36941 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LTBRP36941 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LTBRP36941 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LTBRP36941 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LTBRP36941 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LTBRP36941 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LTBRP36941 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LTBRP36941 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LTBRP36941 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LTBRP36941 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LTBRP36941 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LTBRP36941 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LTBRP36941 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LTBRP36941 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LTBRP36941 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LTBRP36941 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LTBRP36941 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LTBRP36941 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LTBRP36941 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LTBRP36941 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LTBRP36941 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LTBRP36941 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LTBRP36941 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LTBRP36941 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LTBRP36941 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LTBRP36941 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LTBRP36941 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LTBRP36941 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LTBRP36941 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LTBRP36941 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LTBRP36941 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LTBRP36941 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LTBRP36941 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LTBRP36941 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LTBRP36941 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LTBRP36941 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LTBRP36941 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LTBRP36941 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LTBRP36941 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LTBRP36941 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LTBRP36941 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LTBRP36941 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LTBRP36941 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LTBRP36941 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LTBRP36941 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LTBRP36941 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LTBRP36941 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LTBRP36941 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LTBRP36941 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LTBRP36941 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LTBRP36941 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LTBRP36941 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LTBRP36941 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LTBRP36941 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LTBRP36941 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LTBRP36941 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LTBRP36941 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LTBRP36941 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LTBRP36941 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LTBRP36941 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LTBRP36941 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LTBRP36941 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LTBRP36941 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LTBRP36941 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LTBRP36941 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LTBRP36941 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LTBRP36941 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LTBRP36941 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LTBRP36941 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LTBRP36941 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LTBRP36941 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LTBRP36941 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LTBRP36941 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LTBRP36941 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LTBRP36941 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTBRP36941 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTBRP36941 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTBRP36941 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTBRP36941 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTBRP36941 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTBRP36941 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTBRP36941 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTBRP36941 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTBRP36941 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTBRP36941 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTBRP36941 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTBRP36941 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTBRP36941 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms