Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms