Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms