Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC1P35052 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC1P35052 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC1P35052 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC1P35052 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC1P35052 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC1P35052 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC1P35052 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC1P35052 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC1P35052 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC1P35052 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC1P35052 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC1P35052 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC1P35052 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC1P35052 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC1P35052 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC1P35052 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC1P35052 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC1P35052 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC1P35052 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC1P35052 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC1P35052 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC1P35052 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC1P35052 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC1P35052 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC1P35052 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC1P35052 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC1P35052 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC1P35052 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC1P35052 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC1P35052 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC1P35052 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC1P35052 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC1P35052 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC1P35052 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC1P35052 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC1P35052 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC1P35052 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC1P35052 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC1P35052 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC1P35052 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC1P35052 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC1P35052 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC1P35052 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC1P35052 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC1P35052 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC1P35052 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC1P35052 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC1P35052 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC1P35052 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC1P35052 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC1P35052 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC1P35052 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC1P35052 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC1P35052 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC1P35052 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC1P35052 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC1P35052 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC1P35052 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC1P35052 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC1P35052 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC1P35052 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC1P35052 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC1P35052 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC1P35052 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC1P35052 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC1P35052 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC1P35052 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC1P35052 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC1P35052 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC1P35052 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC1P35052 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC1P35052 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC1P35052 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPC1P35052 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPC1P35052 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPC1P35052 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GPC1P35052 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPC1P35052 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPC1P35052 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPC1P35052 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPC1P35052 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPC1P35052 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPC1P35052 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPC1P35052 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPC1P35052 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPC1P35052 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPC1P35052 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPC1P35052 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPC1P35052 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPC1P35052 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPC1P35052 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPC1P35052 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GPC1P35052 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPC1P35052 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPC1P35052 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPC1P35052 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPC1P35052 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPC1P35052 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPC1P35052 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms