Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CPS1P31327 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CPS1P31327 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CPS1P31327 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CPS1P31327 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CPS1P31327 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CPS1P31327 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CPS1P31327 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CPS1P31327 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CPS1P31327 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CPS1P31327 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CPS1P31327 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CPS1P31327 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CPS1P31327 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CPS1P31327 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CPS1P31327 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CPS1P31327 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CPS1P31327 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CPS1P31327 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CPS1P31327 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CPS1P31327 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CPS1P31327 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CPS1P31327 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
CPS1P31327 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CPS1P31327 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CPS1P31327 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CPS1P31327 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CPS1P31327 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CPS1P31327 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CPS1P31327 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CPS1P31327 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CPS1P31327 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CPS1P31327 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CPS1P31327 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CPS1P31327 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC27.51■■■□□ 2
CPS1P31327 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
CPS1P31327 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
CPS1P31327 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC27.51■■■□□ 2
CPS1P31327 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CPS1P31327 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CPS1P31327 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CPS1P31327 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CPS1P31327 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CPS1P31327 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CPS1P31327 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CPS1P31327 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CPS1P31327 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CPS1P31327 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CPS1P31327 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CPS1P31327 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CPS1P31327 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CPS1P31327 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CPS1P31327 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CPS1P31327 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CPS1P31327 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CPS1P31327 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CPS1P31327 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CPS1P31327 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CPS1P31327 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CPS1P31327 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CPS1P31327 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CPS1P31327 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CPS1P31327 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CPS1P31327 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CPS1P31327 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CPS1P31327 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CPS1P31327 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CPS1P31327 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CPS1P31327 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CPS1P31327 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CPS1P31327 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CPS1P31327 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CPS1P31327 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CPS1P31327 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CPS1P31327 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CPS1P31327 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CPS1P31327 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CPS1P31327 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CPS1P31327 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CPS1P31327 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CPS1P31327 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CPS1P31327 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CPS1P31327 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CPS1P31327 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CPS1P31327 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CPS1P31327 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CPS1P31327 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CPS1P31327 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CPS1P31327 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CPS1P31327 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CPS1P31327 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CPS1P31327 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CPS1P31327 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CPS1P31327 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CPS1P31327 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CPS1P31327 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CPS1P31327 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CPS1P31327 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CPS1P31327 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CPS1P31327 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms