Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC13P31276 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms