Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXA13P31271 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA13P31271 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms