Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms