Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTSSP25774 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTSSP25774 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTSSP25774 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTSSP25774 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTSSP25774 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTSSP25774 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CTSSP25774 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTSSP25774 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTSSP25774 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTSSP25774 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTSSP25774 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTSSP25774 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTSSP25774 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTSSP25774 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CTSSP25774 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CTSSP25774 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CTSSP25774 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTSSP25774 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTSSP25774 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTSSP25774 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTSSP25774 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTSSP25774 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTSSP25774 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTSSP25774 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTSSP25774 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTSSP25774 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTSSP25774 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTSSP25774 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTSSP25774 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CTSSP25774 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTSSP25774 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTSSP25774 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTSSP25774 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTSSP25774 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTSSP25774 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTSSP25774 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTSSP25774 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTSSP25774 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTSSP25774 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTSSP25774 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSSP25774 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSSP25774 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSSP25774 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSSP25774 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSSP25774 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSSP25774 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSSP25774 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSSP25774 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSSP25774 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSSP25774 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSSP25774 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSSP25774 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSSP25774 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSSP25774 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSSP25774 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSSP25774 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSSP25774 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSSP25774 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSSP25774 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSSP25774 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSSP25774 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSSP25774 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSSP25774 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSSP25774 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSSP25774 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSSP25774 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSSP25774 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSSP25774 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSSP25774 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSSP25774 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSSP25774 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSSP25774 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSSP25774 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSSP25774 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSSP25774 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSSP25774 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSSP25774 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSSP25774 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSSP25774 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSSP25774 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSSP25774 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSSP25774 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSSP25774 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSSP25774 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSSP25774 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSSP25774 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSSP25774 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSSP25774 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSSP25774 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSSP25774 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSSP25774 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSSP25774 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSSP25774 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSSP25774 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSSP25774 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSSP25774 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSSP25774 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSSP25774 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSSP25774 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms