Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms